基金管理部是中华全国体育基金会的职能部门之一，主要职责是：根据国家有关金融政策、法规和国家统一的财务会计制度，依法管理体育基金，保证体育基金的安全；承担日常财务收支和会计核算、税务等工作；接受社会各界的捐赠和捐助；负责优秀运动员奖学金、助学金，国家队老运动员、老教练员关怀基金的有关材料的汇总、审核、资助金的划拨等；负责部分老运动员、老教练员医疗保健待遇工作；承担各专项体育基金的审批和相关工作的宏观管理；承担部分体育基金的保值增值工作；其他运动员、教练员保障性工作。

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